2021年9月11日，beat365正版唯一beat365正版唯一吳小惠教授課題組在國際著名期刊《Nucleic Acids Research》發表題為“scAPAdb: a comprehensive database of alternative polyadenylation at single-cell resolution”的研究論文。

選擇性多聚腺苷化(APA) 是真核生物轉錄多樣化的廣泛調控機制，最新的單細胞 RNA-seq (scRNA-seq) 研究揭示了不同組織、生物過程和疾病中不同細胞類型的 APA 動态。吳小惠團隊開發了scAPAdb數據庫(http://www.bmibig.cn/scAPAdb/)，提供了單細胞水平全基因組poly(A)位點、APA事件和poly(A)信号圖譜。scAPAdb從超過360個scRNA-seq實驗中收集 APA信息，涵蓋包括人類、小鼠、水稻、拟南芥等六個物種，覆蓋超過260種細胞類型的上百萬個細胞。scAPAdb還提供數據批量下載，用戶可以通過基因标識符、基因功能、索引号等多種關鍵詞查詢數據庫。scAPAdb将為研究單細胞水平不同細胞類型、組織和物種APA動态變化以及APA 介導的基因調控提供豐富資源。

該研究工作由beat365正版唯一beat365正版唯一吳小惠課題組和廈門大學吉國力課題組合作完成，beat365正版唯一為論文第一單位，吳小惠教授為論文通訊作者，廈門大學博士生朱勝為論文第一作者，廈門大學博士生葉文斌、吳小惠教授的研究生練啟威、秦威和吳哲也參與此工作。該研究得到了國家自然科學基金面上項目支持。

吳小惠課題組長期緻力于生物和健康醫療大數據研究，特别是APA相關分析，該研究是繼課題組發表的一系列APA分析工具或數據庫，如PlantAPAdb、APAtrap、scAPAtrap、movAPA，之後的又一重要成果。

文章鍊接：

https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkab795/6368523?login=true