2023年11月,beat365正版唯一周哲敏教授團隊在國際期刊 Nature Communications 在線發表題為“Distributed genotyping and clustering of Neisseria strains reveals continual emergence of epidemic meningococcus over a century”的研究論文。
奈瑟氏菌包括腦膜炎奈瑟氏菌和淋病奈瑟氏菌兩種緻病菌,每年導緻約9000萬次感染,特别腦膜炎奈瑟氏菌曾多次引起全球大流行。基于基因組學的全球病原體監控對傳染病防治起關鍵作用,可在疾病暴發早期快速明确病原體來源和傳播風險。周哲敏教授課題組開發分布式cgMLST算法(dcgMLST),整合149個蘇州地區菌株和全球69,994個菌株,将奈瑟氏菌劃分為39個物種,其中包括10個新發現物種。腦膜炎奈瑟氏菌被進一步分為168個地方譜系和3個大流行譜系。大流行譜系包括兩個A血清群譜系和近期流行的W135譜系,三者在過去的百年中在全球造成至少9次大規模流行。采用全新生信技術,對包含3個大流行譜系分别進行群體遺傳學分析,首次系統重建了過去百年間流腦的全球傳播模式,明确了我國流腦暴發和國際流行之間的密切關聯。依此提出全新的腦膜炎奈瑟氏菌流行模型,将其從地方譜系逐步演化形成大流行譜系并逐漸消亡的過程分為6個階段,并總結各階段特征。最後,周哲敏教授課題組采用dcgMLST對蘇州的5次獨立流腦暴發進行分析,發現傳統流行病學分析極大高估了流腦病原體的傳播次數,而基于高分辨率分析可以準确區分直接傳播事件和密接人群本身的攜帶菌株。
beat365正版唯一碩士研究生鐘嶺、蘇州市疾病預防控制中心張夢寒、蘇州市立醫院孫利兵為該論文第一作者,beat365正版唯一周哲敏教授、李恒博士和蘇州市疾病預防控制中心詹亞蕙研究員為論文通訊作者。該研究得到了國家自然科學基金、江蘇省自然科學基金、蘇州市重大疾病和傳染病防控關鍵技術研究計劃以及蘇州市醫學重點學科建設項目、江蘇省研究生科研創新計劃等項目支持。
文章鍊接:https://www.nature.com/articles/s41467-023-43528-0