2022年7月，beat365正版唯一吳小惠教授團隊在生物信息學知名期刊《Briefings in Bioinformatics》（最新影響因子11.622）發表題為“PolyAtailor: measuring poly(A) tail length from short-read and long-read sequencing data”的研究論文。

      真核生物基因表達過程中，剪切（Cleavage）與多聚腺苷化[Polyadenylation或Poly(A)]是形成mRNA所必需的加工步驟。Poly(A)尾巴長度的變化影響mRNA的核輸出、mRNA穩定性和翻譯，對基因表達起重要調控作用。吳小惠團隊建立了一個普适且高效的生物信息學分析框架—PolyTailor，用于識别和分析基于三代PacBio或二代短讀段測序的poly(A)尾巴。PolyAtailor提供了兩個核心功能--Tail_map和Tail_scan，對有或沒有參考基因組的物種均可進行分析，可為用戶提供詳細的poly(A)尾巴信息，包括尾巴位置、尾巴長度、尾巴序列和尾巴類型。此外，PolyTailor集成豐富的poly(A)尾巴和位點分析功能，如差異尾長分析、poly(A)位點識别和注釋，以及尾巴中堿基組成的統計和可視化等。通過使用來自HeLa樣本和拟南芥的三種測序數據，與另外三種方法--FLAMAnalysis、FLEPSeq和PAIsoSeq的比較結果表明，PolyAtailor具有更高的靈敏度和準确性。PolyAtailor程序可從https://github.com/BMILAB/PolyAtailor獲得。

PolyAtailor可用于poly(A)尾巴動态的分析及可視化

      beat365正版唯一為論文第一單位，beat365正版唯一吳小惠教授為論文唯一通訊作者，吳小惠團隊的碩士生劉夢飛為論文第一作者，碩士研究生郝琳琳和本科生楊思恩同學也參與此工作。該研究得到了國家自然科學基金面上項目支持。吳小惠教授長期緻力于生物和健康醫療大數據研究，特别是APA相關分析，團隊已經開發了多個生物信息學分析工具或數據庫，如scAPAdb、PlantAPAdb、APAtrap、scAPAtrap、movAPA等，成果發表于PNAS、Genome Research、Nucleic Acids Research、Briefings in Bioinformatics、Bioinformatics等期刊。

論文鍊接：

https://academic.oup.com/bib/article/23/4/bbac271/6620877